Microscope

Véronique est une enseignante-chercheuse qui veut acheter le kit d'assemblage du micoscope. Pour cela elle a dû le commander sur la plateforme open-source qui proposait les microscopes low-tech. Elle a d'abord discuté avec la communauté de professionnels et particuliers intéressés dans le développement de tels microscopes afin d'obtenir des avis et retours dessus. Convaincue par un autre enseignant de son intérêt pédagogique, elle a pu acheter le kit d'assemblage via un paiement sécurisé en ligne au prix de 100€ et a pu choisir le lieu de livraison parmi diverses structures publiques (universités, centre de recherche, hôpitaux). Elle a donc choisi de le faire livrer à l'UTC, ce qui est le plus pratique pour le récupérer. De manière générale, la livraison prend une semaine. Véronique a commandé le kit le mercredi 5 mars et a reçu le kit le vendredi 14 mars dû à un petit problème de livraison. Cependant, elle s'y était prise en avance et n'a pas eu de problème car le TP n'était programmé que pour la semaine suivante. Lorsqu'elle a récupéré le kit, le livreur lui a fait signer une attestation, puis est reparti pour continuer ses livraisons. Véronique était contente et elle a stocké le carton dans une salle fermée à clés avant de pouvoir l'utiliser avec ses élèves. 

Description : image by Hugo Tessier. Site Benjamin Franklin de l’UTC

Valeurs : Convivialité (partager)

Tensions : /

Leviers : Consumérisme (besoin)

Nikolaï est chercheur dans un laboratoire estonien. Lors de ses études, il a étudié le codage en C++ de façon approfondie mais n'a qu'eu des bases en python. Il travail actuellement sur les microscopes low-techs et étudie l'Enderscope. Etant spécialisé en bio-informatique, il aimerait pouvoir ajouter des fonctionnalités au microscope. En effet, il aimerait développer un module d'analyse dans le but d'observer des tissus de cellules vivantes. Ce projet nécessite de nouvelle ligne de code pour faire comprendre à l'ordinateur ce qu'il recherche en terme de zone d'intérêt. Il a pensé à se former en langage python en ligne mais cela serait particulièrement chronophage à l'échelle de ce projet. Cependant, il a réussi à trouver des codes sur la plateforme GitHub qui lui permettrait de pouvoir, d'abord traduire, puis éditer, les codes écrivent pour le microscope à l'origine en python, en C++. Un chercheur américain maîtrisant les deux langages avaient écrit et publié des codes permettant la 'traduction' sur la plateforme open-source suite à un financement d’une entreprise high-tech pour une telle initiative. Il a même donné des commentaires techniques au sujet du fonctionnement de son algorithme sur le forum open source dédié au microscope et à son évolution continue.

Description : image by Animage24 from Pixabay, circuit imprimé ressemblant à l’ordinateur Raspberry Pi embarqué sur le microscope

Valeurs : Responsabilité (équité)

Tensions : Croissance (innovation)

Leviers : /

Natacha est une lycéenne avec la spécialité SVT. Dans le cadre de son cours, elle réalise un projet sur les différentes techniques de microscopie. Son professeur met en avant le côté environnemental et low-tech du projet en demandant à ses élèves de chercher des alternatives au microscope optique. Cela tombe bien puisque l'oncle de Natacha est un chercheur en biologie cellulaire et qu'il lui a récemment parlé du nouveau microscope que son laboratoire avait acquis : un Enderscope. Ce microscope est fait à partir d'une imprimante 3D détournée. Pour faire découvrir à ses camarades l'Enderscope, Natacha avec l'aide de son oncle a réalisé une vidéo explicative. Dans sa vidéo, elle montre comment allumer le microscope puis comment placer l'échantillon à observer. Elle montre également comment déplacer l'échantillon afin d'obtenir différentes vues. Elle joue aussi avec le réglage de la lumière qui se fait manuellement. En classe, Natacha a pu montrer sa vidéo à ses camarades pour accompagner sa présentation de l'Enderscope. Son professeur lui a même conseillé de publier sa vidéo sur PeerTube, une plateforme de vidéo en open-source, afin que ce tutoriel soit profitable à tous. 

Valeurs : Partage (convivialité),  Lien (responsabilité)

Leviers : Ataraxie (imagination)

Tensions : Besoin (consumérisme)

Gaspard est enseignant chercheur à l'université d'Aix-Marseille. Aujourd'hui il se rend à l'EnderFest, un festival autour du microscope "enderscope" se déroulant une fois par an. Tous les ans, ce festival prend place dans une ville différente qui est partenaire de la communauté autour de l'enderscope. Lors de se festival, des chercheurs du monde entier utilisant l'enderscope ou intéressés par ce microscope sont présents. A travers des conférences, ils pourront présenter les modules et fonctionnalités qu'ils ont mis au point au cours de l'année pour l'utilisation qu'ils font du microscope. Chacun pourra alors se renseigner sur les dernières avancées, et sur ce qui se fait ailleurs. Ce festival est l'occasion de rencontrer des chercheurs, de découvrir l'enderscope, et surtout de partager les nouvelles techniques et projets à venir. Cette année, le festival est à Paris, en France, donc Gaspard venant de Marseille peut faire le déplacement. Il assiste à une conférence sur le développement d'un module permettant la mesure des microplastiques dans l'océan, puis sur l'utilisation du microscope dans une serre fermée de non-contamination. Enfin, il participe à un échange visant à optimiser l'écriture du code utilisé pour le smart scanning.

Valeurs : Lien (responsabilité), Partage (convivialité)

Leviers : Littératie (optimisation)

Tensions : Innovation (croissance), Besoin (consommation, publicité)

Dylann est un lycéen à Angers qui suit la spécialité SVT en terminale. Après son bac, il aimerait suivre une licence de biologie afin de travailler à terme en laboratoire. Il a vu un matin dans un couloir une affiche réalisée par sa professeure de SVT qui met en avant un temps d'apprentissage sur un tout nouveau microscope lowtechisé s'appelant l'Enderscope. Dylann apprécie particulièrement les nouvelles technologies et se dit que cela pourrait le faire rêver un peu avant ses études supérieures. Il en a parlé à ses copains le soir même qui sont partants pour aller assister à la séance. La séance s'est déroulée comme suit : un chercheur de l'université d'Angers ayant travaillé dans l'équipe de développement de l'Enderscope est venu au sein de son lycée avec un son Enderscope. Il l'a mis en place avant la séance en 1h et a ensuite invité chacun à prendre place. Il a réalisé quelques prises de vues d'un échantillon, un passage en smart scanning et raster scan. Il a ensuite réalisé une présentation orale interactive et a terminé par un temps d'échanges. Il a donné son mail aux élèves présents et les a invités à rejoindre un forum de discussion créé spécialement pour tous les élèves parrainés. Ceci leur permettra de créer un réseau dans le monde de la recherche scientifique.

Natacha souhaite publier une vidéo explicative sur l'utilisation du microscope sur PeerTube. Elle se créé d'abord un compte sur la plateforme et doit choisir une communauté : l'instance qui lui correspond le plus selon le thème abordé et ses conditions d'utilisation. Une fois son compte créé, elle importe sa vidéo dans laquelle elle montre les différentes fonctionnalités du microscope. Avant de la publier, elle choisit les paramètres de confidentialité de sa vidéo et elle l'a mis en publique. Elle fait ensuite du chapitrage, c'est à dire qu'elle sépare sa vidéo selon les thèmes abordés. Pour cela, elle clique sur mise à jour, puis sur l'onglet chapitres, et dans le champ timecode ajoute une partie précise de la vidéo (h:mm:ss) pour définir le début et la fin d'un chapitre, puis ajoute le titre du chapitre. Elle sépare sa vidéo en 4 chapitres : introduction sur la microscopie; comment allumer le microscope; placer l'échantillon à observer; et comment régler la lumière. Elle clique ensuite sur l'icone mise à jour et publie sa vidéo. 

Valeurs : Partage (convivialité)

Leviers : /

Tensions : Besoin (consumérisme)

Nina est une développeuse embauchée par l'université d'Angers. Elle a pour mission de créer une plateforme support à la communauté autour de l'Enderscope. Elle créé donc une plateforme de partage composée d'un site web collaboratif où chacun peut y ajouter ses avancées, ainsi que de différents canaux de communication. La plateforme de partage est hébergée sur GitHub. Un site collaboratif est dédié à l'Enderscope. Il comporte plusieurs pages :

• ses composants : quels sont-ils, où s'en procurer, comment organiser une collecte de matériau   

• sa fabrication : comment monter le microscope, quels sont les différents modules; renvoie à des vidéos sur peertube   

• son utilisation : comment se servir du microscope, pour qui ce microscope est-il fait, les différentes utilisations possibles, renvoie également à des tutoriels sur peertube   

• le code    

• les modules optionnels : chacun peut rajouter le module qu'il développe pour une utilisation particulière   

• la réparation : comment réparer le microscope   

• commande de l'Enderscope : comment commander, à quel prix, où le récupérer

Le site contient aussi un forum organisé en plusieurs canaux suivant le motif de la discussion : organisation de collecte de matériau de récupération, erreurs à faire remonter, conseils à donner, développement de nouveaux modules optionnels, informations générales importantes, événements (festival, conférences...). 

Xavier est un chercheur à l'Institut Pasteur travaillant dans une unité d'urgence en microbiologie. Il se déplace régulièrement en France pour analyser des échantillons directement sur le terrain et dispose pour cela d'un laboratoire mobile avec un Enderscope. La dernière fois qu'il a utilisé l'Enderscope, il a remarqué que le réglage de la luminosité ne fonctionnait plus lorsqu'il utilisait en simultané un module optionnel pour le diagnostic d'une bactérie. Il souhaite partager ce problème à l'ensemble de la communauté afin de les prévenir d'un dysfonctionnement et aussi pour savoir si quelqu'un d'autre a déjà rencontré un problème similaire et s'il sait le résoudre. Pour cela Xavier se rend sur le site GitHub dédié à l'Enderscope, puis se dirige vers le forum dédié aux erreurs. Il poste un message expliquant son problème. 2h plus tard, il obtient une réponse d'un chercheur en Autriche qui a fait face à un problème similaire qui était lié à un problème de mauvais ajustement du code vis-à-vis du module optionnel rajouté. Xavier sait désormais qu'il doit modifier une partie du code. Il envoie par ailleurs une notification à l'ensemble de la communauté sur le canal : informations importantes , expliquant qu'il faut adapter le code lorsqu'un module optionnel est utilisé et joint un lien avec le code à ajouter.